Sargassum (Rumput laut)
Umumnya, rumput laut membawa tiga filum yang terdiri dari: Chlorophyceae (ganggang hijau), Phaeophyceae (alga coklat), dan Rhodophyceae (alga merah). Di setiap filum, itu terdiri dari ribuan berbagai jenis. Di negara-negara Asia, rumput laut telah akrab dimanfaatkan baik sebagai makanan maupun tradisional obat berabad-abad lalu oleh banyak orang. Dikenal sebagai sumber metabolit fungsional, perhatian masyarakat telah berkembang pesat ke arah itu. Beberapa metabolit fungsional yang dimiliki oleh rumput laut adalah potensinya sebagai antibakteri, antivirus, antikanker, antihipersensitif, antidiabetes, dan antiinflamasi. Jadi, database 2020 dari Food dan Organisasi Pertanian (FAO) mencatat
meningkatkan produksi rumput laut telah tiga kali lipat dari 10,6 juta ton pada tahun 2000 mencapai 32,4 juta ton pada 2018.
Florotanin, fucoxanthin, fucoidan, alginat, fukosterol, merodeterpenoid dan asam fenolik merupakan jenis senyawa bioaktif yang dominan dalam Sargassum sp. Aktivitas biologis dari bioaktif senyawa Sargassum yaitu antioksidan, antikanker,antitumor, antialergi, antiinflamasi, antihipertensi, antiobesitas, antidiabetes, antimikroba, anti-pencoklatan, neuroprotektif dan hipokolesterolemia. Terpenoid dapat mempengaruhi
berbagai mekanisme inflamasi yang timbul pada respon terhadap berbagai faktor etiologi karena studi komprehensif mekanisme terpenoid telah menunjukkan efek terapeutik pada peradangan.
Metode in silico dapat digunakan secara efektif dalam menemukan interaksi zat aktif dengan Sargassum sp. sampai ke tingkat molekuler. Studi in silico dianggap sebagai langkah utama yang sangat berguna dalam menemukan kandidat perawatan atau pengobatan sebelum penelitian in vitro atau in vivo.
Penyelidikan ini dimaksudkan untuk mengkaji dan menganalisis efek pencegahan dalam zat aktif dari
Surgassum sp terhadap perkembangan CGRP dan TNF-α pada migrain.
BAHAN dan METODE
Struktur protein dan ligan
Basis data PubChem (https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/) digunakan sebagai sumber informasi di mana
zat aktif dari Sargassum sp diperoleh dari seperti yang ditunjukkan pada Tabel 1.
Struktur tiga-dimensi
CGRP dan TNF-α a dihasilkan dari database Laboratorium INBIO atau dari Research Kolaborasi Protein Bioinformatika Struktural Bank Data (RCSB PDB) (https://www.rcsb.org/).
Docking molekuler
Autodock Vina pada program PyRx 9.5 digunakan untuk proses docking molekuler. Tabel 2 menyajikan target proses docking molekuler berupa protein.
Dari proses docking molekuler, diturunkan ramalannya dari potensi interaksi antara reseptor dan ligan dalam hal untuk afinitas mengikat mereka. Semakin banyak skor negatif menunjukkan semakin kuat
hubungan. Indikasi bahwa aktivitas antagonis terjadi dari zat yang diperiksa terhadap protein target saat diuji zat menampilkan skor yang mendekati satu kontrol.Olcegepant dan 6,7-DIMETHYL-3-[(METHYL{2-[METHYL({1-[3-(TRIFLUOROMETIL)FENIL]-1H-INDOL-3-YL}METIL)
AMINO]ETIL} AMINO)METIL]- 4H-CHROMEN-4-ONE menjadi protein target dari proses docking ini. Visualisasi hasil docking molekuler diturunkan dengan menggunakan PyMol 2.3.1. LigPlot
2.1. diterapkan untuk menghasilkan interaksi asam amino. Ikatan antara reseptor dan inhibitor kontrol ditiru menggunakan a grid box sebagai proses docking khusus yang dilakukan dalam penelitian ini.
Analisis Docking molekuler.
Proses docking khusus yang dilakukan dalam penyelidikan ini dengan peniruan ikatan antara reseptor dan kontrol inhibitor obat menggunakan kotak kotak. Prediksi potensi interaksi antara reseptor dan ligan dalam kaitannya dengan afinitas pengikatan skor diperkirakan menggunakan proses docking. Interaksi yang lebih kuat ada antara reseptor dan ligan ditampilkan oleh lebih nilai negatif. Hal ini juga dapat menunjukkan bahwa suatu aktivitas sebagai penghambat protein target oleh metabolit yang mendekati kemampuan obat inhibitor ketika metabolit yang diperiksa memiliki skor di dekat angka satu.
Sargassum sp mengandung zat aktif yang meliputi tanin, triterpenoid dan fukoidan. Afinitas pengikatan untuk setiap zat dengan CGRP dan TNF-α diindikasikan menggunakan docking molekuler. Itu indikasi hubungan yang lebih kuat diungkapkan oleh skor yang lebih negatif dari afinitas yang mengikat. Kompleks struktur kristal CGRP dengan olcegepant sebagai inhibitor kontrol, juga dengan TNF-α dengan 6,7-DIMETHYL-3-[(METIL{2-[METIL({1-[3-(TRIFLUOROMETIL) FENIL]- 1H-INDOL-3YL}METIL)AMINO]ETIL} AMINO)METIL]-4H-CHROMEN-4-ONE sebagai inhibitor kontrol adalah target dari docking molekuler ini. Gambar 1 dan 2 menampilkan visualisasi hasil docking molekuler dengan PyMol 2.3.1. Tabel 3 menyajikan bahwa skor paling negatif terungkap dalam tanin dengan afinitas terkuat dibandingkan dengan CGRP, diikuti oleh triterpenoid, kontrol dan fucoidan.
Sementara itu, Triterpenoid menunjukkan afinitas terkuat dengan yang paling skor negatif dibandingkan dengan TNF-α, diikuti oleh kontrol, dan fucoidan seperti terlihat pada Tabel 4.
Berdasarkan hasil docking, metabolit rumput laut memiliki potensi besar sebagai inhibitor CGRP dan TNF-α karena skor afinitas mengikat dekat dengan kontrol. CGRP dan TNF-α meningkat dalam kondisi migrain, diharapkan pemberian Sargassum sp dapat membantu menormalkan kadar protein.
Aktivitas antiinflamasi dan antinosiseptif baik secara in vitro dan in vivo ditemukan di Terpenoid dari Ganja. Dampaknya beroperasi secara independen dari TNF-α. Terpenoid dalam pameran Cannabis hanya imunosupresi sesaat, dengan demikian, dengan menggunakannya, peradangan dapat diatasi. Terpenoid banyak ditemukan pada tumbuhan sebagai sumber yang kaya. Perkembangan pembengkakan sendi kronis adalah dapat dihambat oleh terpenoid. Selanjutnya, terpenoid berkontribusi ke berbagai mekanisme yang berkorelasi dengan peradangan yang muncul sebagai reaksi berbagai faktor etiologi.
Ada tiga zat tanin, terpenoid dan fucoidon di Sargassum sp, yang berpotensi sebagai anti migrain. Terpenoid dan nilai afinitas pengikatan tanin lebih tinggi dibandingkan zat lain.
Terpenoid dan fucoidon memiliki residu asam amino yang serupa. Karena itu, zat aktif dalam Sargassum sp memiliki efek penghambatan pada terjadinya CGRP dan TNF-α pada migrain berdasarkan studi in silico
Keterangan: Informasi detail dari riset ini dapat dilihat pada tulisan kami di: melalui link sbb: https://scholar.google.co.id/scholar?q=sargassum+in+silico+terpenoid+fucoidan+cgrp&hl=en&as_sdt=0&as_vis=1&oi=scholart#d=gs_qabs&u=%23p%3D2fNWhui5uPUJ
Olivia Mahardani Adam, Jusak Nugraha, Mohammad Hasan Machfoed, Agus Turchan. In silico Study on the Promising Active Components of Terpenoid and Fucoidon from Sargassum sp. in Inhibiting CGRP and TNF-α. Pharmacognosy Journal December 2021, Vol13 (6s),.pp 1715 – 1719.
