Perbandingan E-Test dengan Agar Dilution Method

Share on facebook
Share on google
Share on twitter
Share on linkedin
Ilustrasi oleh microbiology notes

Resistensi antibiotik yang disebabkan oleh kegagalan pemberantasan Helicobacter pylori dan tingkat resistensi sangat bervariasi di dunia. Dalam mengevaluasi resistensi antibiotik H. pylori, Agar Dilution Method (ADM) adalah gold standar dalam pengujiannya. Akan tetapi, menggunakan metode ini dalam praktik sehari-hari itu melelahkan.dan membutuhkan banyak biaya, oleh karena itu E-test telah direkomendasikan untuk metode yang rumit. E-test lebih disukai pada praktik klinis karena memiliki biaya yang lebih rendah dan lebih sedikit memakan waktu. Metode ini telah diterapkan di Indonesia oleh penelitian lain, tetapi jarang untuk H.pylori. Pengujian E-test telah divalidasi pada populasi di Eropa, Brasil dan Amerika. Bedasarkan hal tersebut penelitian ini bertujuan memvalidasi E-test dan mendeteksi adanya bias antara metode pengenceran ADM dan E-test. Dilakukan dengan menguji kerentanan orang Indonesia dengan mengisolasi lima antibiotik (amoksisilin, klaritromisin, metronidazol, tetrasiklin, dan levofloxacin).

Mengingat pentingnya pengujian kerentanan antibiotik untuk H. pylori, sangat penting untuk memilih metode pengujian yang memberikan akurasi tinggi dan layak untuk pengaturan klinis. Pedoman CLSI EP-09 digunakan untuk membandingkan prosedur pengukuran dan estimasi bias. Dalam penelitian ini, menggunakan antibiotik fve untuk 72 galur H. pylori yang diperoleh dari pasien klinis di Indonesia. Sampel yang digunakan dikelompokkan menjadi kelompok sensitive dan resistant menurut kriteria EUCAST clinical breakpoint.  Hasil E-test menunjukkan prevalensi resistensi yang lebih tinggi terhadap semua antibiotic diuji tetapi perbedaannya tidak signifikan. Untuk semua antibiotic (amoksisilin dan klaritomisin) kecuali tetrasiklin memiliki nol perbedaan median yang diukur dengan MIC dan menunjukkan tidak ada bias konstan antara E-test dan ADM. Dari hasil analisis korelasi Spearman mengkonfirmasi bahwa korelasi ini signifikan untuk amoksisilin (r = 0,53, P ≤ 0,001), klaritromisin (r = 0,56, P ≤ 0,001), dan tetrasiklin (r = 0,76, P ≤ 0,001). Sensitivitas, spesifisitas, dan AUC untuk E-test membedakan strain yang resisten terhadap masing-masing perhitungan antibiotic. Untuk resistensi amoksisilin dengan E-test menunjukkan sensitivitas rendah tetapi spesifisitas tinggi dengan nilai AUC yang baik.

Untuk klaritromisin, sensitivitasnya juga rendah tetapi spesifisitas dan AUC tinggi. Untuk metronidazole dan levofloxacin, itu E-test menunjukkan sensitivitas yang cukup tinggi, spesifisitas dan AUC. Ditemukan bahwa tingkat resistensi yang diperoleh dari E-test menunjukkan perbedaan yang sedikit lebih tinggi dibandingkan dengan ADM, meskipun secara statistik tidak signifikan menurut analisis McNemar; mirip dengan penelitian sebelumnya.

Terdapat perbedaan hasil antara pengamatan menggunakan ADM dan E-test. Alasan adanya perbedaan ini diakibatkan oleh beberapa faktor yaitu pada prosedur untuk menyimpan strip E-test dapat mempengaruhi konsentrasi obat, dan inkubasi dalam lingkungan mikroaerofilik yang dapat mempengaruhi aktivitas antibiotik, terutama untuk makrolida Ukuran inokulum memuliki bakteri dengan ukuran besar saat diuji dengan strip E-test, sementara di ADM, sejumlah kecil bakteri diinokulasidi piring agar yang mengandung antibiotik. Perbedaan dalam rasio bakteri / antibiotik mungkin menghasilkan lebih tinggi kemampuan pertumbuhan strain, menghasilkan yang lebih tinggi tingkat resistensi diukur dalam E-test dari ADM.

Secara umum, E-test dapat mendeteksi terlalu tinggi resistensi terhadap antibiotik, tetapi mungkin dapat diterapkan karena menunjukkan kesamaan yang baik dengan hasil ADM untuk levofoxacin, metronidazole, clarithromycin, dan tetrasiklin. Sesuai dengan persetujuan untuk nilai MIC dengan Bland-Altman dan Passing-Bablok menunjukkan bahwa kedua metode tersebut dapat digunakan secara bergantian dengan sensitivitas dan spesifisitas yang baik. Namun, perbedaan pendapat dari amoksisilin mungkin diperlukan konfirmasi lebih lanjut. Salah satu batasan dari penelitian ini adalah tes tidak dilakukan di pusat laboratorium lain untuk memeriksa reproduktifitas metode. Isolat yang digunakan dalam studi ini dikumpulkan pada tahun 2015 dan disimpan di −80 ° C. Meskipun efek penyimpanan beku pada sensitivitas antibiotik pada H. pylori bervariasi antara penelitian, hal ini mungkin menjelaskan perbedaan MIC yang ditemukan dalam penelitian ini.

Penulis: Muhammad Miftahussurur, Kartika Afrida Fauzia, Iswan Abbas Nusi, Poernomo Boedi Setiawan, Ari Fahrial Syam, Langgeng Agung Waskito, Dalla Doohan, Neneng Ratnasari5, Ali Khomsan, I. Ketut Adnyana, Junko Akada and Yoshio Yamaoka.

Informasi yang lebih rinci dari penelitian ini dapat dilihat pada artikel kami di BMC Research Notes, berikut kami sertakan link rujukannya,

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6954499/pdf/13104_2019_Article_4877.pdf

Berita Terkait

UNAIR News

UNAIR News

Media komunikasi dan informasi seputar kampus Universitas Airlangga (Unair).